近日，华中农业大学植物科学技术学院教授边银丙领衔的研究团队，首次使用群体基因组方法探究了具有重要经济价值食用菌的进化史，解析了香菇适应性进化的遗传基础，研究结果将为香菇优良品种选育提供重要参考依据。相关成果发表于《先进研究杂志》。
香菇是全球最重要的食用菌，产量占世界栽培食用菌总产量的22%，居各种类首位。生态适应和人工选择都可推动香菇基因组的进化，但其表型—基因型—适应性之间的联系尚不明确。
研究团队基于133个香菇菌株，开展了基因组重测序和栽培试验。群体基因组研究将供试菌株分为3个亚群，亚群间具有显著的地理分布特征、表型分化和温度响应差异。3个亚群独立分化于36871世代以前，现代香菇栽培品种可能起源于我国东北附近地区。
结合基因组扫描和全基因组关联分析，研究团队发现了大量与群体间遗传和表型分化相关的候选基因。其中，环境响应、信号转导、转录调控、细胞周期调控、真菌细胞壁重塑、蛋白质降解以及代谢和运输相关功能基因尤为重要。结合子实体发育的转录组研究发现，相当一部分群体分化相关基因参与了子实体发育的过程。研究团队构建了香菇适应性进化过程中遗传和表型分化的模型。研究结果表明，这对当地环境，特别是温度的适应引发了香菇群体的遗传和表型分化。
