近日，《自然—通讯》在线发表了武汉大学生命科学学院教授吴旻、武汉大学中南医院消化内科教授叶梅团队在结直肠癌全基因组图谱分析方面的最新成果。团队研究建立了结直肠癌临床组织的全面的活性增强子图谱，鉴定出10多个超级增强子在结直肠癌中的作用，发现调控PHF19和TBC1D16的超级增强子是致癌的超级增强子，揭示KLF3是一个新的结直肠癌致癌转录因子，为结直肠癌研究提供了重要表观基因组数据和新的关键调控因子。
结直肠癌是世界上发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一。近期的表观遗传组学研究发现，增强子活性增强是多种癌症的共同特征之一，可能作为癌症诊断和治疗的新靶点。
在这项工作中，研究者获得了147个H3K27ac ChIP-Seq、144个RNA-Seq、147个全基因组测序和86个H3K4me3 ChIP-Seq样本，在结直肠癌病人组织中鉴定出了5590个获得的差异增强子位点和1100个缺失的差异增强子位点、334个获得的差异超级增强子位点（gain VSELs）和121个缺失的差异超级增强子位点。
研究者验证了10个gain VSELs在结直肠癌细胞系中的功能，抑制VSELs的活性能显著抑制临近靶基因的表达以及结直肠癌细胞的迁移能力，其中抑制超级增强子PHF19和TBC1D16有效抑制了结直肠癌细胞的裸鼠成瘤能力。
研究者还预测了结直肠癌中的多个关键转录因子，并发现抑制转录因子KLF3的表达，可有效抑制结直肠癌细胞的迁移能力以及裸鼠成瘤能力，证明KLF3是一个新的促进结直肠癌的转录因子。
